ปี พ.ศ. 2536 กรมการศึกษานอกโรงเรียน กระทรวงศึกษาธิการ โดย ดร.รุ่ง แก้วแดง อธิบดีกรมการศึกษานอกโรงเรียน ได้ประกาศจัดตั้งศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอทั่วประเทศ จำนวน 612 อำเภอ และมีคำสั่งกรมการศึกษานอกโรงเรียน ที่ 94/2537 เรื่อง ให้ข้าราชการไปปฏิบัติราชการในหน้าที่หัวหน้าศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอ จำนวน 596 ราย สั่ง ณ วันที่ 18 มกราคม 2537 และให้เริ่มปฏิบัติราชการตั้งแต่วันที่ 2 กุมภาพันธ์ 2537 ศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอกิ่งอำเภอน้ำขุ่น สถานที่ตั้งเดิมอาคารด้านข้างที่ว่าการ (อาคารอาสาสมัครรักษาดินแดนปัจจุบัน)
ในปี พ.ศ. 2540 กรมการศึกษานอกโรงเรียน กระทรวงศึกษาธิการ ได้ประกาศจัดตั้งศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอกิ่งอำเภอน้ำขุ่น เมื่อวันที่ 24 พฤษภาคม 2540 และในปีงบประมาณ 2541 ได้พิจารณาจัดสรร เงินงบประมาณ เพื่อก่อสร้างอาคารห้องสมุดประชาชนกิ่งอำเภอน้ำขุ่น (แบบ ข.–2540) ปรับปรุงครั้งที่ 1 / 2551 วงเงินงบประมาณ 1,257,000 บาท และเงินสมทบบำรุงการศึกษาของศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนกิ่งอำเภอ น้ำขุ่น จำนวน 193,000 บาท รวมเป็นเงิน 1,450,000 บาท ส่วนที่ดินในการก่อสร้างอาคารได้รับการสนับสนุนจาก ผู้มีจิตศรัทธาบริจาคที่ดินในการก่อสร้าง คือ นายโฮม ฮะเจริญ บริจาคที่ดินจำนวน 2 ไร่ นายสนั่น ทองจิตร จำนวน 3 ไร่ รวมที่ดินจำนวน 5 ไร่ และอาคารได้ดำเนินการก่อสร้างเสร็จแล้วใช้เป็นอาคารห้องสมุดประชาชนอำเภอน้ำขุ่นจนถึงปัจจุบัน
ต่อมาได้มีพระราชบัญญัติส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย พ.ศ. 2551 ประกาศในราชกิจจานุเบกษา เมื่อวันที่ 3 มีนาคม พ.ศ. 2551 และมีผลบังคับใช้เมื่อวันที่ 4 มีนาคม 2551 ได้เปลี่ยนชื่อจากศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอน้ำขุ่นเป็น ศูนย์การศึกษานอกระบบและการศึกษา ตามอัธยาศัยอำเภอน้ำขุ่น (กศน.อำเภอน้ำขุ่น) โดยดำเนินการจัดการศึกษานอกระบบระดับการศึกษา ขั้นพื้นฐาน เปิดทำการสอนตั้งแต่ระดับผู้ไม่รู้หนังสือ ระดับประถมศึกษา ระดับมัธยมศึกษาตอนต้น และระดับมัธยมศึกษาตอนปลาย จัดกิจกรรมการเรียนรู้การศึกษาต่อเนื่อง ประกอบด้วย งานการศึกษาเพื่อพัฒนาทักษะอาชีพ งานการศึกษาเพื่อพัฒนาทักษะชีวิต งานการศึกษาเพื่อพัฒนาสังคมและชุมชน จัดกิจกรรมการศึกษาตามอัธยาศัย รวมทั้งงานตามนโยบายเร่งด่วนของรัฐบาล